DICCIONARIO MÉDICO
Haplotipo
El haplotipo es un conjunto de alelos o variantes genéticas situados en una misma región cromosómica que tienden a heredarse en bloque. En la práctica clínica, el concepto de haplotipo se emplea sobre todo en el contexto del sistema HLA de histocompatibilidad, los estudios de asociación genómica y la farmacogenética. La palabra es un acrónimo acuñado a partir del inglés haploid genotype («genotipo haploide»). Se refiere al conjunto de variantes genéticas presentes en un mismo cromosoma que, por encontrarse físicamente próximas, se transmiten juntas de padres a hijos con una frecuencia mayor de la que cabría esperar por azar. La Real Academia Española lo define como «conjunto de alelos localizados en una región de un cromosoma, que suelen heredarse como un bloque». La razón por la que estas variantes viajan juntas es el ligamiento genético. Durante la meiosis, los cromosomas homólogos intercambian fragmentos mediante recombinación; pero si dos loci están muy cerca uno del otro, la probabilidad de que un punto de entrecruzamiento caiga entre ambos es baja, y los alelos de esa región pasan casi siempre como una unidad a la generación siguiente. Cuando la asociación entre variantes supera lo esperable por cercanía física, se habla de desequilibrio de ligamiento. El ejemplo más conocido en medicina es el del complejo mayor de histocompatibilidad humano (HLA), ubicado en el brazo corto del cromosoma 6. Los genes HLA de clase I (HLA-A, HLA-B, HLA-C) y clase II (HLA-DR, HLA-DQ, HLA-DP) se heredan como un bloque haplotípico: cada persona recibe un haplotipo HLA de su padre y otro de su madre. La probabilidad de que dos hermanos compartan ambos haplotipos es del 25 %, lo que explica por qué la búsqueda de un donante HLA idéntico para trasplante comienza siempre entre los hermanos del paciente. Determinados haplotipos HLA aparecen con una frecuencia llamativamente alta en ciertas poblaciones. El haplotipo A1-B8-DR3, por ejemplo, es uno de los más comunes entre europeos del noroeste y se asocia con mayor susceptibilidad a varias enfermedades autoinmunes. Que un haplotipo se conserve intacto a lo largo de muchas generaciones sugiere que la selección natural ha podido favorecer (o al menos no penalizar) esa combinación concreta de alelos. A gran escala, los haplotipos funcionan como etiquetas genéticas. El Proyecto Internacional HapMap, desarrollado entre 2002 y 2010, catalogó los bloques haplotípicos más frecuentes del genoma humano y los polimorfismos de nucleótido único (SNP) que los identifican. Esa cartografía permitió diseñar los chips de genotipado que se emplean en los estudios de asociación de genoma completo (GWAS): en lugar de analizar los millones de variantes existentes, basta con tipificar unos centenares de miles de SNP marcadores para inferir la mayor parte de la variación genómica. En farmacogenética, ciertos haplotipos del gen VKORC1 condicionan la dosis de anticoagulantes cumarínicos que cada paciente necesita. Los portadores del haplotipo A de VKORC1 requieren dosis notablemente más bajas de acenocumarol o warfarina, un dato que algunos algoritmos de dosificación ya incorporan. Algo similar ocurre con los haplotipos del citocromo CYP2D6 y la respuesta a determinados analgésicos opioides y antidepresivos. Dado que los bloques haplotípicos se fragmentan lentamente con cada generación (solo la recombinación los rompe), su distribución entre poblaciones conserva una huella de la historia migratoria y demográfica de la especie humana. Los haplotipos del ADN mitocondrial y del cromosoma Y, que se heredan sin recombinación, han sido particularmente informativos para reconstruir rutas de migración y datar la divergencia entre grupos humanos. Es una contracción del inglés haploid genotype. La denominación refleja que el haplotipo representa el genotipo presente en un solo cromosoma (la versión haploide), no la combinación de ambos cromosomas homólogos. El genotipo abarca la totalidad de los alelos que un individuo posee en un locus o en su genoma completo, incluyendo las dos copias de cada cromosoma. El haplotipo describe únicamente la serie de variantes que viajan juntas en un mismo cromosoma. Cada persona tiene, para una región dada, dos haplotipos (uno paterno y otro materno) que combinados dan su genotipo. Porque la compatibilidad entre donante y receptor se evalúa comparando sus haplotipos HLA. Cuantos más alelos HLA compartan, menor es el riesgo de rechazo del injerto y de enfermedad injerto contra huésped. Sí. Las técnicas actuales de genotipado y secuenciación permiten determinarlos. La tipificación HLA se realiza de rutina en laboratorios de inmunología antes de cualquier trasplante de órgano o de progenitores hematopoyéticos. HLA: sistema de antígenos leucocitarios humanos, el ejemplo clínico más conocido de herencia haplotípica. Alelo: cada una de las formas alternativas de un gen en un locus determinado. Polimorfismo: variación en la secuencia de ADN presente en una proporción apreciable de la población. Desequilibrio de ligamiento: asociación no aleatoria entre alelos de loci próximos. Genotipo: constitución genética completa de un individuo.Qué es un haplotipo
Haplotipos y sistema HLA
Aplicaciones en genómica y farmacogenética
Haplotipos en genética de poblaciones
Preguntas frecuentes
¿Qué significa la palabra «haplotipo»?
¿En qué se diferencia un haplotipo de un genotipo?
¿Por qué los haplotipos HLA importan en los trasplantes?
¿Se pueden conocer los haplotipos de una persona?
Referencias
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Infografías realizadas con https://BioRender.com
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