Microbiologie Clinique
« Le développement de nouvelles technologies, plus rapides et plus précises, a fait du diagnostic moléculaire un outil essentiel pour l’équipe clinique, au bénéfice direct du patient. »
DR. JOSÉ LUIS DEL POZO LEÓN DIRECTEUR. SERVICE DE MICROBIOLOGIE CLINIQUE

Le Service de Microbiologie identifie, au moyen de divers procédés de laboratoire, la cause des maladies infectieuses ainsi que les agents antimicrobiens potentiellement efficaces.
Pour identifier ces causes et élaborer une thérapie efficace, il est indispensable, en premier lieu, d’isoler et d’identifier les micro-organismes responsables de chaque tableau clinique.
Les maladies infectieuses ont été transformées grâce aux tests de diagnostic moléculaire. L’explication principale de ce développement tient à la difficulté de détecter un agent pathogène par la microbiologie classique. Les longues périodes de croissance des micro-organismes, les conditions de culture et l’obtention d’un échantillon adéquat sont les facteurs majeurs qui influencent le diagnostic microbiologique traditionnel.
Étant donné que les techniques de biologie moléculaire reposent sur la détection de segments d’ADN, la présence d’un micro-organisme viable dans l’échantillon n’est pas nécessaire : son seul matériel génétique suffit.
Les valeurs élevées de sensibilité et de spécificité des techniques de diagnostic moléculaire, associées à la rapidité avec laquelle les résultats peuvent être obtenus, en ont fait les techniques de choix pour le diagnostic des maladies infectieuses.
L’émergence, dans notre pays, de maladies tropicales peut être due aux mouvements de population, tels que l’immigration et le tourisme, qui favorisent l’arrivée de micro-organismes en provenance d’autres régions du monde. La collaboration étroite entre les cliniciens prenant en charge les voyageurs et les immigrants et les médecins responsables du laboratoire facilite l’atteinte des objectifs diagnostiques en optimisant les ressources.
La Clinique dispose en outre d’un Laboratoire de Biosécurité de niveau 3 (BL3), qui permet la manipulation d’agents biologiques provoquant des maladies potentiellement létales chez l’être humain. Le laboratoire présente une conception et des caractéristiques particulières, et tous les échantillons y sont traités à l’aide d’équipements de protection appropriés.
Le personnel de ce laboratoire possède une formation spécifique au maniement des pathogènes et des agents potentiellement létaux et est supervisé par des scientifiques compétents expérimentés dans le travail avec ces agents.

Avez-vous besoin que nous vous aidions ?
Unités spécialisées pour une meilleure prise en charge
EN NAVARRE ET À MADRID
BACTÉRIOLOGIE
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Échantillons stériles, exsudats et hémocultures (conventionnelles et quantitatives)
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Cultures pour la prévention de l’infection néonatale
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Cultures sur milieux liquides et solides
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Détection d’antigènes pour un diagnostic rapide
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Techniques rapides d’identification et profils de sensibilité aux antimicrobiens
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Détection et surveillance des mécanismes de résistance aux antimicrobiens
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MALDI TOF
MYCOBACTÉRIES (BL3)
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Tuberculose et autres mycobactérioses
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Cultures conventionnelles et automatisées
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Détection d’antigènes et techniques moléculaires d’identification
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Détermination du profil de sensibilité aux antibiotiques par des techniques automatisées et moléculaires
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Techniques rapides d’identification et profils de sensibilité aux antimycobactériens
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MALDI TOF
SÉROLOGIE
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Diagnostic sérologique des maladies infectieuses par détection d’anticorps/antigènes (ELISA, immunofluorescence, immunochimiluminescence, agglutination)
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Détermination de l’immunité cellulaire spécifique (Quantiferon) vis-à-vis du CMV et de la tuberculose
VIROLOGIE
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Culture et maintien de lignées cellulaires pour l’isolement des virus
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Techniques rapides de détection des antigènes viraux
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Isolement des virus en culture cellulaire et observation de l’effet cytopathique
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Identification virale par techniques de fluorescence et d’anticorps
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Études phénotypiques de sensibilité aux antiviraux des virus de l’herpès simplex
PARASITOLOGIE
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Techniques d’observation directe
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Détection rapide d’antigènes
MYCOLOGIE
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Cultures et techniques d’identification conventionnelles
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Détermination de la sensibilité aux antifongiques
BIOLOGIE MOLÉCULAIRE
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Diagnostic moléculaire basé sur la PCR conventionnelle et en temps réel
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Panels syndromiques basés sur la PCR (méningo-encéphalite, gastro-intestinal, pneumonie, urétrite, ulcérations génitales, etc.)
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Surveillance de la charge virale (hépatites, VIH, herpèsvirus, polyomavirus, adénovirus, etc.)
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Génotypage viral et détection de mutations de résistance aux antiviraux par PCR et séquençage
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Identification bactérienne et fongique par PCR et séquençage
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AGENTS BIOLOGIQUES
Laboratoire de biosécurité niveau 3
Dans le cadre des mesures de biosécurité requises pour ce type d’installations, le laboratoire BL3 du Service de Microbiologie Clinique a été conçu conformément à la législation canadienne, l’une des plus avancées et offrant le plus haut niveau de sécurité, ainsi qu’aux directives de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS).
Agents biologiques
Parmi les micro-organismes traités dans les laboratoires BL3 figurent ceux responsables de la grippe aviaire, de l’anthrax, de la tuberculose, de la fièvre de Malte, de la dengue, du VIH ou de la maladie de la vache folle.
Activité du laboratoire
Détection d’agents biologiques du groupe 3 (selon le RD 664/97) dans des échantillons cliniques, principalement par isolement, culture, puis identification et étude de la sensibilité aux agents antimicrobiens.
Installations
Les installations comprennent quatre compartiments indépendants (sas) de passage obligatoire avant d’accéder au laboratoire, afin que l’air circule uniquement vers l’intérieur du laboratoire et ne sorte jamais vers l’extérieur.

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- Technologie de pointe.
- Rapidité du diagnostic afin de débuter précocement le traitement le plus approprié.
- Travail en équipe avec les autres professionnels de la Clinique.
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